第二代生物技术，直接面向农业、制药与医疗应用开发的生物技术，不同于第一代面向生命科学实验室的生物技术。
一是建立技术研发平台 – 主要包括：1）基因克隆与表达 – 转基因生物技术，2）药物机理与筛选 – 系统医药技术；二是建立贸易销售平台 – 主要包括两类：1）媒体信息与软件部分（包括信息软件、网络资讯、广告设计、会展新闻等），2）仪器与基因试剂部分（包括生物器材、试剂药品、基因载体、细胞资源等）。

一、分子细胞生物技术

1）动物细胞培养、突变，
2）基因重组、载体构建，基因克隆、测序、表达，
3）报导基因标记、启动子分析，
4）RNAi技术、基因沉默，
5）转基因技术、蛋白质稳定表达，
6）DNA、RNA核酸杂交，荧光定量PCR，
7）cDNA基因芯片、差异显示技术，
8）蛋白质免疫杂交、分析，
9）药物分子色谱分析，等。

二、生物系统计算技术

讲座论坛：系统生物工程与图式（系统）遗传学（2007年）
          - 细胞发生的信号传导与基因表达调控

         系统（图式）遗传学与合成生物学：21世纪的工业革命（2008年）
         - 人工设计生物系统与转基因系统生物技术