近年來土壤污染事件頻發，土壤污染會影響農產品的產量和品質、危害人居環境安全、威脅生態環境安全。土壤污染問題已經成為繼大氣污染、水污染之后引起全社會高度關注、急需解決的重大環境問題。有數據顯示，我國受鹽漬化影響的耕地約占全國耕地總面積的8.5%，而酸性土壤的比例則高達25%。此外，水、土、氣是個循環系統，水體和空氣污染物大約有80%最終進入土壤。在剛剛落下帷幕的兩會中，土壤污染防治成為熱門話題，土壤污染防治立法也在有序推進。
土壤污染的污染源多種多樣，可能是未經處理或未達排放標準的工業廢水、固體廢棄物，也可能是使土壤酸化的以自然降水的形式進入土壤的酸雨，更可能的是化肥和農藥的過量和不當使用。
按照“一控兩減三基本”的要求，深入開展化肥使用量零增長行動。有機肥以原料來源廣，數量大，養分全，改土培肥效果好而得到大力推廣，農業廢棄物、工業廢棄物、生活垃圾、城市污泥、禽畜糞便這些都能拿來做有機肥原料。但是因行業標準的不完善、產品質量參差不齊、現有技術難以對原料無害化處理等問題，有機肥對土壤也存在巨大的害處和隱患，迫使有機肥成為土壤污染的又一污染源。
1.禽畜糞便。其中含有大腸菌、線蟲等病菌和害蟲及抗生素，未腐熟有機物料會導致病蟲害的傳播、作物發病，對食用農產品的人體健康也產生影響；在土壤中發酵時，容易滋生病菌與蟲害。
2.城市淤泥。含有大量的化學物質殘留，有內在水份比例高很難脫水，成份非常復雜、有害物質含量高、有一定的粘性等特殊性，有可能附著在土壤中，被作物吸收。
3.城市生活垃圾。病菌、病毒、害蟲等的滋生地和繁殖地，會破壞了土壤的結構和理化性質，使土壤保肥、保水能力大大下降。
4.工業固體廢物。特別是有害固體廢物，能殺滅土壤中的微生物，是土壤喪失腐解能力，導致草木不生，嚴重者會破壞土壤內的生態平衡。
目前有機肥存在著極大的污染土壤的風險。隨著土壤污染防治立法進程加快，會從法律層面倒逼企業進行生產技術改進，完善有機肥相關行業標準，嚴格把控產品質量，促進有機肥行業規范化發展。
