過量施用化肥不僅導致土壤板結、酸化加劇、鹽堿化嚴重，而且導致肥料利用率極低，浪費嚴重，地下水遭受污染，果樹長勢差，農產品品質下降，農民種地效益低。基于此，國家農業部提出了在作物不減產的條件下化肥施用零增長的目標。
化肥施用過量的三大危害
01削弱植物生產能力
植物和人一樣，吃得太飽不僅不利于成長，而且會不利于健康。據全國測土配方施肥專家組組長、中國農業大學資源與環境學院院長張福鎖教授介紹，施肥過量對莊稼造成危害的結果主要有兩個：一個是容易倒伏，倒伏一旦出現，就必然導致糧食減產；另一個是容易發生病蟲害，氮肥施用過多，會使植物抗病蟲能力減弱，易遭病蟲侵染。
02加劇環境污染
據調查，大氣里面隨著降雨、沙塵暴等自然現象降下來的氮素，1公頃可以達到80千克，而高產小麥1公頃才需要160～180千克氮素。也就是說種在土地中的小麥僅從大氣中就獲得近一半的養分。植物從大氣中通過葉片的氣孔吸進二氧化碳，與根系吸收的水分生成碳水化合物，并釋放出氧氣和熱量，這一過程叫做光合作用。光合作用形成碳水化合物，碳水化合物進一步合成淀粉、脂肪、纖維素或氨基酸、蛋白質、原生質或者核酸、葉綠素、維生素以及其他各種生命必需物質，并由這些物質構造出植物體來。
如果仍按照以前的肥料用量施肥，就會造成施肥過量。過多施用的肥料量超過土壤的保持能力時，就會流入周圍的水中，形成農業面源污染，造成水體富營養化，導致藻類滋生，繼而破壞水環境。
03浪費大量緊缺資源
氮、磷、鉀是植物所需營養的“三要素”。大氣中的氮氣是絕大多數莊稼不能利用的氮素形態，必須通過消耗大量能源把它變成氨氣態活性氮，轉化成能夠被植物利用的其他形態作為肥料。過去生產氮肥主要以石油為原料，現在靠天然氣和煤。這些能源都是我國的緊缺資源，這也正是化肥生產成本居高不下的原因之一。
